E'
disponibile online
il
primo catalogo
delle
cicatrici del Dna
, chiamato '
Riparioma umano
': contiene
migliaia di mutazioni
che possono essere indotte dai
meccanismi molecolari di riparazione
quando intervengono sulla doppia elica in caso di danno. Questo nuovo
strumento
, utile per
decifrare i tumori
e sviluppare
nuove terapie su misura
, è
pubblicato
sulla rivista Science dal Centro spagnolo per la ricerca sul cancro (Cnio), che lo ha reso
liberamente accessibile
per consentire
ai ricercatori di tutto il mondo
di
verificare rapidamente
come
ciascuno dei 20.000 geni umani
influenza la
riparazione del Dna
.
Queste
informazioni
potranno essere molto
preziose
dal punto di vista clinico perché saper interpretare la cicatrizzazione del Dna nelle cellule tumorali di un paziente può aiutare a
ricostruirne l'evoluzione
, dal danno originario alla successiva riparazione. "Questo è molto rilevante per il trattamento del
cancro
, perché molte
terapie
antitumorali
agiscono
proprio
causando rotture del Dna
", osserva Felipe Cortés del Cnio. I
trattamenti
antitumorali
spesso
perdono efficacia
perché le
cellule malate
imparano a riparare le rotture
causate dai farmaci, diventando
resistenti alla terapia
. Capire come la cellula ripara le rotture può dunque aiutare a superare la resistenza.
Il Riparioma si occupa specificamente della
riparazione
di uno dei tipi più gravi di danno al Dna, le
rotture
che
colpiscono simultaneamente entrambi
i filamenti della molecola
: possono essere causate da un errore durante la replicazione o da fattori esterni, come l'esposizione ai raggi X, alla luce solare (radiazioni Uv) oppure ai farmaci.
Per realizzare un
catalogo delle cicatrici
lasciate da simili danni, i ricercatori hanno
generato circa 20.000 popolazioni cellulari
,
disattivando un gene
diverso
in ciascuna di esse;
in ognuna
hanno poi
causato delle rotture
utilizzando lo strumento di editing genetico
Crispr
, e infine hanno
osservato
l'impronta (
cicatrice
) lasciata
sulla molecola di Dna dopo la riparazione
.
Uno dei principali progressi che hanno reso possibile lo studio è stata la possibilità di eseguire questa
analisi
massiva
simultaneamente
su
tutte le 20.000 popolazioni di cellule
, anziché su ciascuna singolarmente. Lo studio ha inoltre richiesto "un
notevole sforzo computazionale
, incluso lo sviluppo di nuovi strumenti di analisi e rappresentazione", spiega Daniel Giménez, ricercatore del gruppo di Dinamica cromosomica del Cnio.
Secondo gli autori della ricerca, il Riparioma potrà contribuire al
miglioramento dell'editing genetico con la Crispr
, che si basa proprio sull'induzione di rotture del Dna per introdurre dei cambiamenti mirati nel genoma. Inoltre considerano il Riparioma come "una
piattaforma per nuove scoperte
": grazie a questo strumento, infatti, hanno già
individuato
un modello di
mutazioni
correlato sia al
cancro del rene
che a condizioni di
bassa ossigenazione
(ipossia) in altri tumori, tutte informazioni che
in futuro
potrebbe portare a
nuovi approcci terapeutici
.
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